La sede central del CITA se encuentra localizada en la Avda. Montañana 930, en el kilómetro 7,5 de la carretera que une el barrio de Montañana con San Mateo de Gallego, dentro del Campus de Aula Dei.
Además del CITA, en el Campus se ubican la Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC) del CSIC, el Instituto Pirenaico de Ecología (IPE) del CSIC, el Instituto Agronómico Mediterráneo de Zaragoza/Centro de Altos Estudios Mediterráneos (IAMZ/CIHEAM) y la Fundación para la Innovación y Transferencia Agroalimentaria de Aragón. Además, del Centro de Protección Vegetal, el Laboratorio Agroalimentario, el Centro de Transferencia Agroalimentaria y el Centro de Semillas y Plantas de Vivero, todos ellos pertenecientes al Departamento de Agricultura, Ganadería y Medio Ambiente del Gobierno de Aragón. El CITA es sede asimismo del Instituto Agroalimentario de Aragón (IA2).