La técnica eddy covariance (o covarianza de toberllinos en español) permite la medida directa del intercambio neto de vapor de agua, dióxido de carbono, y otros gases efecto invernadero (ej. metano) con la atmósfera a escala parcela con una resolución de 30 minutos. Esta metodología se puede utilizar para estudiar sistemas agrícolas, ganaderos y forestales e incluso entornos urbanos.

Actualmente, el Departamento de Sistemas Agrícolas, Forestales y Medio Ambiente (SAFMA-CITA), en colaboración con la Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC), gestiona dos estaciones eddy covariance donde se está monitorizando el secuestro/emisión de CO2 y el consumo de agua junto con otras variables ecofisiológicas y ambientales en dos bosques de encina con distintos tratamientos. Estas estaciones son las primeras estaciones permanentes de Aragón y forman parte de la red mundial FLUXNET.